《瑪利歐vs.咚奇剛》是 Game Boy Advance 上的解謎動作平台遊戲，結合跳躍、探索與機關解謎。玩家操控瑪利歐穿越各式關卡，躲避敵人、取得鑰匙並救出迷你瑪利歐，還要善用箱子、開關和環境物件開路。後續關卡也加入引導玩具前進的玩法，考驗玩家的時機掌握與路線規劃。