《洛克人3：威利博士的最後！？》是經典橫向捲軸動作平台遊戲，玩家操控洛克人穿越關卡、躲避陷阱並擊敗各式機器人首領。擊敗首領後可取得其特殊武器，運用不同能力迎戰後續關卡，並追查威利博士的陰謀。